卡塔爾時間3月11日，卡塔爾衛生部宣布，該國當日新冠肺炎確診病例激增238例，累計確診病例達262例。為防止新冠疫情蔓延，卡塔爾宣布禁止伊朗、韓國、意大利等14國的人員入境。近日，卡塔爾航空飛中國的部分航班暫停延期至4月底。

北京時間3月9日，卡塔爾航空公司宣布，推出靈活退改簽政策，以積極應對疫情影響。卡塔爾航空決定，已經預定或將要預定的旅行日期在2020年6月30日前的卡塔爾航空客票均可享受免費改期，或免費兌換有效期為一年的旅行券，需要在航班出發前三天提出退改申請。

針對中國航線，卡塔爾航空將暫停往返北京、上海、廣州、成都、重慶、杭州的航班運營，延期至2020年4月30日，往返香港的航班正常運營。此外，卡塔爾針對中國航線發布退改簽處理政策，2020年3月7日23:59前出票的往返中國七大航點的客票，旅行日期在2020年2月3日-2020年4月30日的乘客可聯系原出票渠道辦理，通過代理商(包括在線旅行預訂平臺)預訂的乘客，可聯系相關代理商處理，通過卡塔爾航空官網(qatarairways.com)、卡塔爾航空客服中心預訂的乘客可登錄管理頁面Manage My Booking申請退改簽。

此外，針對仍在運營的航班安全問題，卡塔爾航空表示，已采取了最嚴苛的衛生作業標準，包括對飛機進行定期清潔、消毒等措施，并使用國際航空運輸協會(IATA)及世界衛生組織(WHO)建議的有效航空器消毒產品。與此同時，卡塔爾航空在內部開展員工培訓項目，加強一線員工的防控措施，保障乘客的健康出行。

卡塔爾航空機隊的所有飛機都裝有先進的HEPA高效空氣過濾器(High Efficiency Particulate Air Filter)，可有效阻擋循環空氣中99.97%的病毒和細菌污染顆粒，從而維持客艙空氣的新鮮與清潔，為乘客在飛行途中提供有效防護。為了營造安全舒適的出行環境，卡塔爾航空已對包括織物和毛毯在內的機供用品采取高溫清洗、干燥和壓制作業流程，確保高溫殺菌的效果;機上耳機則在航后回收并拆取外部海綿套后，進行無死角嚴格清潔。